I documenti del ramo di Michele di Vincenzo Marzi medici sono entrati nelle carte dell'Archivio Naldini dopo la morte di Cristoforo (1666-1737) che aveva sposato, appunto, Maria Virginia Naldini. La coppia non aveva avuto figli e Maria Virginia lasciò l'eredità avuta dal marito ai nipoti, figli del fratello Ottaviano Naldini (testamento del 20 aprile 1741).

 L'archivista Angelo Morelli che, alla matà dell'Ottocento, effettuò il riordno dei documenti, li divise in sei serie:

I. Documenti (1380 in copia, 1517-1720), 9 buste nn. 59-67;

II. Lettere (sec. XVII-XVIII), 2 buste nn. 68-69;

III. Cause e processi (1430-1727), 11 buste 70-80;

IV. Scrittura patrimoniale (1567-1736), 36 registri nn. 81-127 (mancanti i nn. 94-102, 121-122);

V. Ricevute e saldi (1618-1736), 9 buste nn. 128-136;

VI. Addenda di lettere (1670-1736), 5 buste nn. 136/1-136/5.